Langs het spoor tussen de Kanaalweg en het Centraal Station in Leiden staan een groot aantal hoge bomen, waarvan velen dicht langs het spoor. ProRail vreesde problemen met het treinverkeer door afbrekende takken die veelal tot ver over het spoor groeiden. Omdat de bomen niet zomaar gekapt konden worden of rigoureus teruggesnoeid konden worden zijn er langs het 2,7 km lange spoortrace in totaal 846 bomen geïnventariseerd. Daarbij is o.a. de kwaliteit van de bomen, de hoogte en de standplaats tot het spooropgenomen om een inschatting van het potentiële risico voor het spoor te kunnen maken. In samenspraak met ProRail, Gemeente Leiden, aanwonenden en Bomenbond Rijnland is er op basis van de inventarisatie een breed gedragen beheerplan opgesteld voor de bomen langs het spoor. Het beheerplan voorziet in vooraf vastgelegde beheerwerkzaamheden die het behoud van de bomen nastreeft in combinatie met het wegnemen van de potentiële risico’s voor het treinverkeer.